Data Scientist, Bioinformatiker (m/w/d)

Die Forschungsdatenmanagement-Initiative German Human Genome-Phenome Archive (GHGA) ist Teil des Nationalen Programms für Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) und fungiert als nationaler Knotenpunkt innerhalb des föderierten European Genome-Phenome Archive (EGA) und der European Genomics Data Infrastructure (GDI). Als Schlüsselkomponente der deutschen Forschungsinfrastrukturlandschaft entwickelt und betreibt die GHGA Softwaretools für die sichere Daten- und Metadatenspeicherung, interaktive Datenportale mit Datenvisualisierung sowie optimierte Lösungen zur Datenablage und -erfassung. GHGA ist außerdem ein wichtiger Infrastrukturanbieter für das deutsche Nationale Genomsequenzierungsprojekt genomDE / MV GenomSeq. Datenverwalter / Bioinformatiker (wissenschaftlicher Mitarbeiter, E13 TV-L, 100 %) Wir suchen einen Datenverwalter / Datenmanager mit bioinformatischem Hintergrund für den Betrieb des Datenmanagementsystems innerhalb von GHGA, GDI und dem MV GenomSeq. Im Rahmen dieser Rolle übernehmen Sie die Verantwortung für die Moderation alltäglicher Aktivitäten auf dem Datenportal, interagieren mit Kunden/Datenübermittlern und Benutzern, optimieren und erweitern bestehende Betriebsprotokolle und leiten auch die Produktentwicklung, indem Sie Benutzerfeedback für neue Versionen des GHGA-Toolsets einbeziehen. Der erfolgreiche Kandidat wird Teil eines interdisziplinären Forschungs- und Datenmanagementteams sein, das eine Vielzahl modernster Methoden entwickelt und anwendet, um Bioinformatik-Workflows in einer Cloud-Computing-Umgebung zu implementieren und aufrechtzuerhalten. Die Rolle beinhaltet eine enge Zusammenarbeit mit anderen Partnern im GHGA-Netzwerk, innerhalb von GDI und MV GenomSeq. Als neu gestartetes Projekt bietet die GHGA ihren Mitarbeitern von Beginn an Gestaltungsspielraum bei der Projektumsetzung. Mit Ihrem Beitrag helfen Sie der GHGA dabei, ihre Mission zu erfüllen, Omics-Daten in Deutschland zugänglicher zu machen und die deutsche Genomforschung national und international voranzutreiben. Mit Ihrer Expertise setzen Sie Standards innerhalb Deutschlands und machen Deutschland zu einem starken Akteur im internationalen Bemühen. Ihre Aufgaben: Identifizierung geeigneter Datensätze und Analyse ihres Potenzials für den Datenaustausch. Qualitätskontrolle von Datensätzen und Vorbereitung von Daten und Metadaten für die Einreichung. Entwicklung und Implementierung von Datensicherheitskonzepten, einschließlich Risikomanagement. Entwicklung und Implementierung von SOPs für das Datenmanagement von Human-Omics-Daten als Teil der GHGA-Infrastruktur. Strategie und Prozesse für die Datenaufnahme, Metadatenvalidierung und Qualitätskontrolle von Daten. Bearbeitung von Datenzugriffsanfragen und Verwaltung der notwendigen rechtlichen Prozesse. Präsentation und Verbreitung von Datenmanagementkonzepten innerhalb des Konsortiums und auf (inter)nationaler Ebene Konferenzen Etablierung datengesteuerter Qualitätskontrollstrategien Verfolgen Sie den Bereich des sicheren Datenhandlings und -austauschs sowie die Interaktion mit internationalen Initiativen wie der Global Alliance for Genomics and Health (GA4GH) genau. Anforderungen: Master-Abschluss oder gleichwertige Qualifikation in Bioinformatik, Computational Biology, Biowissenschaften, Informatik, Physik, Mathematik, Ingenieurwesen oder anderen Bereichen, möglicherweise mit einem Doktortitel. Nachgewiesene Erfahrung und Fachwissen in der Entwicklung von Datenmanagement-/Datenkurationskonzepten wird erwartet. Fachwissen in NGS (menschlich) Omics-Daten, Datensicherheit und Datenschutz sind von Vorteil, ebenso wie die Kommunikation von Ergebnissen und Ideen mit Kollegen und (inter)nationalen Kooperationspartnern. Kenntnisse im Umgang mit UNIX-basierten Systemen und relevanten Programmiersprachen wie Python oder R sind Voraussetzung. Erfahrung mit der Entwicklung und Implementierung strukturierter Metadaten unter Verwendung von Modellierungssprachen wie LinkML und JSON Schema ist von Vorteil. Kenntnisse in Softwareentwicklung und Cloud Computing sind von Vorteil. Ausgezeichnete Zusammenarbeits- und Kommunikationsfähigkeiten in Englisch. Der ideale Bewerber sollte die Fähigkeit gezeigt haben, unabhängig und kreativ zu arbeiten. Der Kandidat sollte über ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeiten verfügen und in der Lage sein, die technischen Anforderungen klar zu formulieren, klare Ziele zu setzen und in einem interdisziplinären Umfeld zu arbeiten und mit anderen Partnern zu kommunizieren. Die Universität Tübingen bekennt sich zu Gerechtigkeit und Vielfalt und setzt sich aktiv für Chancengleichheit ein. Die Universität ist bestrebt, den Anteil von Frauen in Forschung und Lehre zu erhöhen und fordert daher qualifizierte Frauen dringend zur Bewerbung auf. Bewerber mit Behinderung werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt. Ihre Möglichkeiten: Lernen Sie eine Vielzahl von Bereichen kennen, die von KI-gesteuerter klinischer Entscheidungsfindung bis hin zu moderner Webentwicklungstechnologie reichen
gies Arbeiten Sie mit einem interdisziplinären Expertenteam zusammen und bringen Sie modernste biomedizinische Forschung näher an Kliniken und Patienten. Nehmen Sie an internationalen Organisationen wie der Global Alliance for Genomics and Health (GA4GH), dem European Genome Phenome Archive (EGA) und ELIXIR teil und gestalten Sie die Zukunft der Genomik über Grenzen hinweg. Erweitern Sie Ihr Fachwissen durch umfangreiche Möglichkeiten von Schulungsprogrammen, Seminaren und Konferenzen. Genießen Sie ein flexibles Arbeitsumfeld mit der Möglichkeit, Teilzeit von zu Hause aus zu arbeiten und Büropräsenz und Remote-Arbeit in Einklang zu bringen