Científico de datos, bioinformático (m/f/d)

La iniciativa de gestión de datos de investigación Archivo Alemán del Genoma y Fenoma Humano (GHGA) es parte del programa nacional para la infraestructura de datos de investigación (NFDI) y actúa como un nodo nacional dentro del Archivo Europeo del Genoma y Fenoma (EGA) federado y la Infraestructura Europea de Datos Genómicos (GDI). Como componente clave dentro del panorama de infraestructura de investigación alemán, GHGA desarrolla y opera herramientas de software para el almacenamiento seguro de datos y metadatos, portales de datos interactivos con visualización de datos y soluciones optimizadas de depósito y adquisición de datos. GHGA también es un proveedor de infraestructura clave para el proyecto nacional alemán de secuenciación del genoma genomDE/MV GenomSeq. Administrador de datos / Bioinformático (personal científico, E13 TV-L, 100%) Buscamos un Administrador de datos / Administrador de datos con experiencia en bioinformática para operar el sistema de gestión de datos dentro de GHGA, GDI y MV GenomSeq. Como parte del puesto, asumirá la responsabilidad de moderar las actividades diarias en el portal de datos, interactuar con los clientes/remitentes de datos y usuarios, optimizar y ampliar los protocolos operativos existentes y también guiar el desarrollo del producto incorporando comentarios de los usuarios para las nuevas versiones del conjunto de herramientas GHGA. El candidato seleccionado formará parte de un equipo interdisciplinario de investigación y gestión de datos que desarrollará y aplicará una amplia gama de metodologías de última generación para implementar y mantener flujos de trabajo bioinformáticos en un entorno informático en la nube. El papel implicará una estrecha cooperación con otros socios de la red GHGA, dentro de GDI y MV GenomSeq. Como proyecto lanzado recientemente, GHGA ofrece a sus empleados espacio para dar forma a la implementación del proyecto desde el principio. Su aporte ayudará a GHGA a alcanzar su misión de hacer que los datos ómicos en Alemania sean más accesibles y ayudar a impulsar la investigación del genoma alemán, a nivel nacional e internacional. Su experiencia definirá los estándares dentro de Alemania y permitirá que Alemania sea un actor fuerte dentro de los esfuerzos internacionales. Sus responsabilidades: Identificación de conjuntos de datos adecuados y análisis de su potencial para compartir datos Control de calidad de los conjuntos de datos y preparación de datos y metadatos para su envío Desarrollo e implementación de conceptos de seguridad de datos, incluida la gestión de riesgos Desarrollo e implementación de SOP para la gestión de datos ómicos humanos como parte de la infraestructura de GHGA Estrategia y procesos para la ingesta de datos, validación de metadatos y control de calidad de los datos Manejo de solicitudes de acceso a datos y gestión de los procesos legales necesarios Presentar y difundir conceptos de gestión de datos dentro del consorcio y en conferencias (inter)nacionales Establecimiento de estrategias de control de calidad basadas en datos Siga de cerca el campo del manejo e intercambio seguro de datos y la interacción con iniciativas internacionales como la Alianza Global para la Genómica y la Salud (GA4GH) Requisitos: Maestría o título equivalente en bioinformática, biología computacional, ciencias biológicas, informática, física, matemáticas, ingeniería u otros campos, posiblemente con un doctorado. Se espera experiencia y conocimientos demostrados en el desarrollo de conceptos de gestión/curación de datos. Experiencia en NGS. Los datos ómicos (humanos), la seguridad de los datos y la privacidad de los datos son beneficiosos, al igual que comunicar resultados e ideas a colegas y socios de colaboración (inter)nacionales. El dominio de sistemas basados en UNIX y lenguajes de programación relevantes como Python o R es un requisito previo. La experiencia en el desarrollo e implementación de metadatos estructurados utilizando lenguajes de modelado como LinkML y JSON Schema es beneficiosa. La experiencia en desarrollo de software y computación en la nube es beneficiosa. Excelentes habilidades de colaboración y comunicación en inglés. El solicitante ideal debería haber demostrado la capacidad de trabajar de forma independiente y creativa. El candidato debe tener excelentes habilidades de comunicación y ser capaz de articular claramente las necesidades técnicas, establecer objetivos claros y trabajar en un entorno interdisciplinario, comunicándose con otros socios. La Universidad de Tubinga está comprometida con la equidad y la diversidad y promueve activamente la igualdad de oportunidades. La Universidad busca aumentar el número de mujeres en la investigación y la docencia y, por lo tanto, insta a mujeres calificadas a postularse. Se dará preferencia a los solicitantes con discapacidades igualmente calificados. Sus posibilidades: expongase a una gran cantidad de campos que van desde la toma de decisiones clínicas guiada por IA hasta la tecnología moderna de desarrollo web.
gies Trabaje con un equipo interdisciplinario de expertos que acerca la investigación biomédica de última generación a clínicas y pacientes. Participe en organizaciones internacionales como la Alianza Global para la Genómica y la Salud (GA4GH), el Archivo Europeo de Fenómenos Genómicos (EGA) y ELIXIR dando forma al futuro de la genómica a través de las fronteras. Amplíe su experiencia con amplias posibilidades de programas de capacitación, seminarios y conferencias. Disfrute de un ambiente de trabajo flexible con la oportunidad de trabajar desde casa a tiempo parcial, equilibrando la presencia en la oficina y el trabajo remoto.