Data Scientist, Bioinformaticien (h/f/d)

L'initiative de gestion des données de recherche German Human Genome-Phenome Archive (GHGA) fait partie du programme national pour l'infrastructure des données de recherche (NFDI) et agit comme un nœud national au sein de l'archive fédérée européenne du génome-phénome (EGA) et de l'infrastructure européenne des données génomiques (GDI). En tant qu'élément clé du paysage des infrastructures de recherche allemandes, GHGA développe et exploite des outils logiciels pour le stockage sécurisé des données et des métadonnées, des portails de données interactifs avec visualisation des données et des solutions rationalisées de dépôt et d'acquisition de données. GHGA est également un fournisseur d'infrastructure clé pour le projet national allemand de séquençage du génome genomDE / MV GenomSeq. Data Steward / Bioinformaticien (personnel scientifique, E13 TV-L, 100%) Nous recherchons un Data Steward / Data Manager avec une formation en bioinformatique pour exploiter le système de gestion de données au sein de GHGA, GDI et du MV GenomSeq. Dans le cadre de ce rôle, vous aurez la responsabilité de modérer les activités quotidiennes sur le portail de données, d'interagir avec les clients/émetteurs de données et les utilisateurs, d'optimiser et d'étendre les protocoles d'exploitation existants, et également de guider le développement du produit en intégrant les commentaires des utilisateurs pour les nouvelles versions de l'ensemble d'outils GHGA. Le candidat retenu fera partie d'une équipe interdisciplinaire de recherche et de gestion de données développant et appliquant une gamme diversifiée de méthodologies de pointe pour mettre en œuvre et maintenir des flux de travail bioinformatiques dans un environnement informatique cloud. Le rôle impliquera une coopération étroite avec d'autres partenaires du réseau GHGA, au sein de GDI et du MV GenomSeq. En tant que projet récemment lancé, GHGA offre à ses employés la possibilité de façonner la mise en œuvre du projet dès le début. Votre contribution aidera GHGA à atteindre sa mission consistant à rendre les données omiques en Allemagne plus accessibles et à faire progresser la recherche allemande sur le génome, aux niveaux national et international. Votre expertise définira les normes en Allemagne et permettra à l’Allemagne de devenir un acteur important dans les efforts internationaux. Vos responsabilités : Identification des ensembles de données appropriés et analyse de leur potentiel pour le partage de données. Contrôle de la qualité des ensembles de données et préparation des données et des métadonnées pour la soumission. Développement et mise en œuvre de concepts de sécurité des données, y compris la gestion des risques. conférences Établissement de stratégies de contrôle de qualité basées sur les données Suivre de près le domaine de la gestion et du partage sécurisés des données et de l'interaction avec des initiatives internationales telles que l'Alliance mondiale pour la génomique et la santé (GA4GH). Exigences : Maîtrise ou qualification équivalente en bioinformatique, biologie computationnelle, sciences biologiques, informatique, physique, mathématiques, ingénierie ou autres domaines, éventuellement avec un doctorat. Une expérience et une expertise démontrées dans le développement de concepts de gestion/conservation de données sont attendues. Expertise en NGS, données omics (humaines), sécurité des données. et la confidentialité des données est bénéfique, tout comme la communication des résultats et des idées à des collègues et des partenaires de collaboration (inter)nationaux. La maîtrise des systèmes basés sur UNIX et des langages de programmation pertinents tels que Python ou R est une condition préalable. Une expérience dans le développement et la mise en œuvre de métadonnées structurées à l'aide de langages de modélisation tels que LinkML et JSON Schema est bénéfique. Une expertise en développement de logiciels et en cloud computing est bénéfique. Excellentes compétences en collaboration et en communication en anglais. Le candidat idéal doit avoir démontré sa capacité à travailler de manière indépendante et créative. Le candidat doit avoir d'excellentes compétences en communication et être capable d'exprimer clairement les besoins techniques, de fixer des objectifs clairs et de travailler dans un cadre interdisciplinaire, en communiquant avec d'autres partenaires. L'Université de Tübingen s'engage en faveur de l'équité et de la diversité et promeut activement l'égalité des chances. L'Université cherche à augmenter le nombre de femmes dans la recherche et l'enseignement et encourage donc les femmes qualifiées à postuler. Les candidats handicapés, tout aussi qualifiés, auront la préférence. Vos possibilités : soyez exposé à une multitude de domaines allant de la prise de décision clinique guidée par l'IA aux technologies modernes de développement Web.
gies Travaillez avec une équipe interdisciplinaire d'experts rapprochant la recherche biomédicale de pointe des cliniques et des patients Participez à des organisations internationales telles que l'Alliance mondiale pour la génomique et la santé (GA4GH), l'European Genome Phenome Archive (EGA) et ELIXIR qui façonnent l'avenir de la génomique au-delà des frontières Élargissez votre expertise avec de nombreuses possibilités de programmes de formation, de séminaires et de conférences Profitez d'un environnement de travail flexible avec la possibilité de travailler à domicile à temps partiel, en équilibrant la présence au bureau et le travail à distance